Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Speer4aF8VPX6 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.3 ms