Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gm29808-201ENSMUST00000194419 468 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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