Protein–RNA interactions for Protein: F6RXI4

BC067074, cDNA sequence BC067074, mousemouse

Predictions only

Length 2,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC067074F6RXI4 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
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BC067074F6RXI4 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
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BC067074F6RXI4 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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BC067074F6RXI4 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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BC067074F6RXI4 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
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BC067074F6RXI4 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
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BC067074F6RXI4 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
BC067074F6RXI4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
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