Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20518E9Q548 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms