Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddx60E9PZQ1 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms