Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brd1E9PZ26 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brd1E9PZ26 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms