Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gm8968-201ENSMUST00000199133 1303 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gm28826-201ENSMUST00000190006 488 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gm2566-201ENSMUST00000201267 431 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gm19228-201ENSMUST00000214030 717 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gm16210-201ENSMUST00000122161 610 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gm12972-201ENSMUST00000152986 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Prmt1-214ENSMUST00000209124 741 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Mt1-203ENSMUST00000212291 633 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gm6370-202ENSMUST00000198912 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gm8268-201ENSMUST00000209683 458 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gcn1E9PVA8 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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