Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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