Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Usf3B2RUQ2 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms