Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Adcy6-205ENSMUST00000228566 3707 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Olfr764-ps1-201ENSMUST00000204763 2854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Tmem238A9JSM3 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 AC115891.3-201ENSMUST00000219161 2472 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms