Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
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H2-M5A7VMS3 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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H2-M5A7VMS3 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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H2-M5A7VMS3 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
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H2-M5A7VMS3 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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H2-M5A7VMS3 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
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H2-M5A7VMS3 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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H2-M5A7VMS3 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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H2-M5A7VMS3 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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H2-M5A7VMS3 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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H2-M5A7VMS3 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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H2-M5A7VMS3 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
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H2-M5A7VMS3 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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H2-M5A7VMS3 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M5A7VMS3 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
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