Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf39A2RT81 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms