Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms