Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Top3bQ9Z321 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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