Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac5Q9Z2V6 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac5Q9Z2V6 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac5Q9Z2V6 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac5Q9Z2V6 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac5Q9Z2V6 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac5Q9Z2V6 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac5Q9Z2V6 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac5Q9Z2V6 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac5Q9Z2V6 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac5Q9Z2V6 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac5Q9Z2V6 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac5Q9Z2V6 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac5Q9Z2V6 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac5Q9Z2V6 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac5Q9Z2V6 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac5Q9Z2V6 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac5Q9Z2V6 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac5Q9Z2V6 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac5Q9Z2V6 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac5Q9Z2V6 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac5Q9Z2V6 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac5Q9Z2V6 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac5Q9Z2V6 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac5Q9Z2V6 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac5Q9Z2V6 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac5Q9Z2V6 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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Hdac5Q9Z2V6 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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Hdac5Q9Z2V6 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac5Q9Z2V6 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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Hdac5Q9Z2V6 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac5Q9Z2V6 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac5Q9Z2V6 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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Hdac5Q9Z2V6 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
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Hdac5Q9Z2V6 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
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Hdac5Q9Z2V6 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
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Hdac5Q9Z2V6 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Hdac5Q9Z2V6 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Hdac5Q9Z2V6 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac5Q9Z2V6 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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