Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms