Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Sh3bgrQ9WUZ7 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Sh3bgrQ9WUZ7 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Sh3bgrQ9WUZ7 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Sh3bgrQ9WUZ7 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
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