Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pfdn5Q9WU28 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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