Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PdcQ9QW08 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PdcQ9QW08 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PdcQ9QW08 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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PdcQ9QW08 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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PdcQ9QW08 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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PdcQ9QW08 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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PdcQ9QW08 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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PdcQ9QW08 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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PdcQ9QW08 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdcQ9QW08 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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