Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cabp1Q9JLK7 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 349.1 ms