Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ldb3Q9JKS4 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms