Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Chrac1Q9JKP8 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Chrac1Q9JKP8 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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