Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ap3m1Q9JKC8 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms