Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfra4Q9JJT2 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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