Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Gm26143-201ENSMUST00000104480 108 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Olfr1292-ps1-201ENSMUST00000118137 939 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Gm13438-201ENSMUST00000120100 573 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Gm11665-201ENSMUST00000148136 285 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Taf1d-202ENSMUST00000164079 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Prl8a6-201ENSMUST00000018392 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 2610016A17Rik-203ENSMUST00000188711 515 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Gm44422-201ENSMUST00000204142 1025 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 AC153528.1-201ENSMUST00000217696 434 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 E130119H09Rik-201ENSMUST00000223176 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Prl8a6-202ENSMUST00000080762 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Gm19967-201ENSMUST00000179676 2138 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Gm9929-201ENSMUST00000171747 1671 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Sh3bgrl3-202ENSMUST00000105879 518 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Speer4d-202ENSMUST00000119100 857 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Gm11278-201ENSMUST00000121002 997 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Gm25102-201ENSMUST00000122479 112 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Vmn1r-ps18-201ENSMUST00000176901 876 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Gm6113-201ENSMUST00000180319 639 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Gm27001-201ENSMUST00000182252 936 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Gm5251-201ENSMUST00000188959 472 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Gm18547-201ENSMUST00000192439 811 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Gm7443-201ENSMUST00000206355 378 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Prl7d1-201ENSMUST00000021776 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ms4a4bQ9ES61 Gm31763-201ENSMUST00000217788 673 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms