Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE7

Mesd, LRP chaperone MESD, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MesdQ9ERE7 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MesdQ9ERE7 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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