Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB91

Med29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med29Q9DB91 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Med29Q9DB91 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms