Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Med27Q9DB40 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Med27Q9DB40 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Med27Q9DB40 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Med27Q9DB40 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Med27Q9DB40 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Med27Q9DB40 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Med27Q9DB40 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Med27Q9DB40 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Med27Q9DB40 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Med27Q9DB40 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Med27Q9DB40 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Med27Q9DB40 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Med27Q9DB40 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Med27Q9DB40 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Med27Q9DB40 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Med27Q9DB40 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Med27Q9DB40 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Med27Q9DB40 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Med27Q9DB40 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Med27Q9DB40 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Med27Q9DB40 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Med27Q9DB40 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Med27Q9DB40 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Med27Q9DB40 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Med27Q9DB40 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Med27Q9DB40 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Med27Q9DB40 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Med27Q9DB40 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Med27Q9DB40 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Med27Q9DB40 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Med27Q9DB40 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Med27Q9DB40 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Med27Q9DB40 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Med27Q9DB40 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Med27Q9DB40 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Med27Q9DB40 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Med27Q9DB40 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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