Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ccdc7Q9D541 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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