Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

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Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Lonrf3Q9D4H7 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Lonrf3Q9D4H7 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Lonrf3Q9D4H7 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Lonrf3Q9D4H7 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Lonrf3Q9D4H7 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lonrf3Q9D4H7 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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