Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rufy3Q9D394 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy3Q9D394 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy3Q9D394 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy3Q9D394 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy3Q9D394 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy3Q9D394 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy3Q9D394 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy3Q9D394 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy3Q9D394 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy3Q9D394 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy3Q9D394 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy3Q9D394 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy3Q9D394 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy3Q9D394 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy3Q9D394 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy3Q9D394 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy3Q9D394 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy3Q9D394 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy3Q9D394 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy3Q9D394 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy3Q9D394 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy3Q9D394 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy3Q9D394 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy3Q9D394 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy3Q9D394 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy3Q9D394 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy3Q9D394 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy3Q9D394 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy3Q9D394 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy3Q9D394 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy3Q9D394 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy3Q9D394 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy3Q9D394 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy3Q9D394 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy3Q9D394 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy3Q9D394 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rufy3Q9D394 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rufy3Q9D394 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rufy3Q9D394 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rufy3Q9D394 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rufy3Q9D394 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rufy3Q9D394 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rufy3Q9D394 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rufy3Q9D394 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rufy3Q9D394 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rufy3Q9D394 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rufy3Q9D394 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rufy3Q9D394 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rufy3Q9D394 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rufy3Q9D394 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rufy3Q9D394 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rufy3Q9D394 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rufy3Q9D394 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rufy3Q9D394 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rufy3Q9D394 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rufy3Q9D394 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rufy3Q9D394 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rufy3Q9D394 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rufy3Q9D394 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms