Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Zbed3Q9D0L1 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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