Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms