Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mis12Q9CY25 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Mis12Q9CY25 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Mis12Q9CY25 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mis12Q9CY25 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mis12Q9CY25 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mis12Q9CY25 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mis12Q9CY25 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mis12Q9CY25 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mis12Q9CY25 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mis12Q9CY25 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mis12Q9CY25 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mis12Q9CY25 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mis12Q9CY25 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mis12Q9CY25 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mis12Q9CY25 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mis12Q9CY25 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mis12Q9CY25 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mis12Q9CY25 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mis12Q9CY25 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Mis12Q9CY25 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Mis12Q9CY25 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mis12Q9CY25 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mis12Q9CY25 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mis12Q9CY25 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mis12Q9CY25 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mis12Q9CY25 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mis12Q9CY25 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mis12Q9CY25 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mis12Q9CY25 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mis12Q9CY25 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms