Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Sgo1Q9CXH7 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Sgo1Q9CXH7 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Sgo1Q9CXH7 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Sgo1Q9CXH7 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Sgo1Q9CXH7 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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