Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmed5Q9CXE7 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmed5Q9CXE7 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms