Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prkrip1Q9CWV6 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prkrip1Q9CWV6 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms