Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9CWU4 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9CWU4 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9CWU4 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9CWU4 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9CWU4 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9CWU4 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9CWU4 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9CWU4 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9CWU4 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q9CWU4 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms