Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tdrd12Q9CWU0 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms