Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 CT009711.2-202ENSMUST00000224538 973 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 4930598N05Rik-205ENSMUST00000208693 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fcf1Q9CTH6 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms