Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms