Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Nudt21Q9CQF3 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms