Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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