Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 AC107763.1-201ENSMUST00000226082 1365 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtprtQ99M80 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Ccna1-204ENSMUST00000198320 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PtprtQ99M80 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms