Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ciao1Q99KN2 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms