Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Ophn1Q99J31 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ophn1Q99J31 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms