Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
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Ctu1Q99J10 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms