Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Ighv1-86-201ENSMUST00000200562 353 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms