Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms