Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rprd1aQ8VDS4 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rprd1aQ8VDS4 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rprd1aQ8VDS4 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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